蘑菇病虫害综合防治贯彻的原则是“预防为主，综合防治”，要做到“消灭传染源，切断传播途径，控制发病条件，治疗发病区”。

　　具体的综合防治措施如下：把好菌种质量关选用高产、优质、抗病虫害能力强，抗逆性强的菌株。若随意引种没经过审定的菌株，就会有传播病虫害的危险，特别是传播蘑菇病毒病的危险。用于栽培的蘑菇菌种一般应由专业菌种厂生产供应。如省、地、县各级蘑菇菌种站等。优势菌种一般应具备菌龄适宜，生活力强，不带病虫害等特征，外观色泽洁白，打开菌种瓶，可闻到蘑菇香味，凡是菌龄过长，菌丝萎缩或严重徒长，吐黄水，色泽暗淡。以及有绿色、黑色或桔红色等杂菌孢子的菌种都是不合格的菌种，不可采用。