一是植物生长的条件主要是水分，养分和空气，水培花卉的水分和养分绝对能保证其需要，而水中氧气的含氧量会随着花卉的生长而日渐减少，当减少到一定程度时，既会对花卉生长由于缺氧而产生影响，虽然空气中的氧气会不断向水中补充但其补充的数量是远远不够的。

　　二是水培花卉生长在水里的根系，一方面吸收水中的养分。 另一方面又向水中排放一些有机物质，也有废物或毒素，并在水中沉积。而这些有机物在土壤栽培时主要是溶解土壤中不易被根系吸收的养分，而废物和毒素则分布在土壤的空间或从盆底的漏孔中流出，不会被根系吸收而影响花卉的正常生长。而水培的容器中没有底孔，这些有机物，废物或毒素均沉积在水中，很容易再次被植物吸入体内，如此反复吸收，排泄，再吸收，再排泄的恶性循环，十分不利于花卉的正常生长及发挥正常的生理功能。

　　三是水培花卉经常向水里施入的营养肥，除一部分矿质元素被根系吸收外其余的则残留在水里，当残留的物质达到一定数量时，也会对花卉产生一定的危害。四是水培花卉长期生长在水中的根系，会产生一种黏液，黏液多时不但影响花卉根系对营养的吸收，而且还会对水造成污染。由于上述原因，必须对水培花卉进行定期换水和洗根的管理。